番木瓜的蛋白性物质无论试管试验或整体试验均有显著的抗凝作用，在抗凝剂量时(狗，2毫克/千克)，对心血管及呼吸系统无明显作用，大剂量对心脏有直接抑制作用。
由于过敏及引起回肠痉挛，其治疗应用仍受限制。
5、降压作用
番木瓜碱可引起家兔血压下降，对离体蛙心、兔心引起扩张期停止，使蛙后肢血管收缩，兔耳壳、肾脏、小肠及冠状血管舒张。
6、抑制平滑肌作用
番木瓜碱抑制肠管(猫、兔及鼠)及气管(豚鼠)平滑肌，对妊娠子宫(兔及豚鼠)
番木瓜及正常子宫(豚鼠)，少量使之兴奋，大量使之麻痹，对骨胳肌则使之麻痹。种子含番番木瓜甙及芥子酶(Myrosin)，前者和芥干甙类似，水解后产生刺激性挥发物。
7、堕胎作用
果实的浆汁对豚鼠子宫有明显的加强收缩作用，据云种子有堕胎作用，曾用作通经剂及抗刺激剂。
8、心脏和中枢抑制作用
番木瓜碱5毫克给实验动物静脉注射，可引起血压短暂下降，对心脏有抑制作用，减慢心率，5毫克/千克对兔产生毒性反应;此外，有中枢抑制作用。
9、润肤去皱，美容增颜
因为番木瓜性温，不寒不燥，其中的营养容易被皮肤直接吸收，特别是可发挥润肺的功能。
当肺部得到适当的滋润后，就能更好地行气活血，使身体更易吸收充足的营养，从而让皮肤变得光洁、柔嫩、细腻，皱纹减少、面色红润。
10、祛除邪毒
番木瓜中含有番番木瓜碱和番木瓜蛋白酶，它们具有抗结核杆菌及寄生虫如绦虫、蛔虫、鞭虫、阿米巴原虫等作用，故可用治肺结核、蛔虫症、阿米巴肝脓肿等。
